1、所得稅以外的稅，在注冊地單獨申報，稅局給您核定稅種，通過電子稅務局申報；

2、非獨立核算最大區(qū)別是企業(yè)所得稅：總公司匯總后分配分公司，然后總分公司都在所在地繳納。適用于《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法》（國家稅務總局公告2012年第57號印發(fā)，以下簡稱57號公告）的總分公司，屬于匯總納稅企業(yè)，應當適用「統(tǒng)一計算、分級管理、就地預繳、匯總清算、財政調庫」的企業(yè)所得稅征收管理本法。總機構應按照上年度分支機構的營業(yè)收入、職工薪酬和資產(chǎn)總額三個因素計算各分支機構分攤所得稅款的比例;三級及以下分支機構，其營業(yè)收入、職工薪酬和資產(chǎn)總額統(tǒng)一計入二級分支機構;三因素的權重依次為0.35、0.35、0.30。計算公式如下：某分支機構分攤比例=(該分支機構營業(yè)收入/各分支機構營業(yè)收入之和)×0.35+(該分支機構職工薪酬/各分支機構職工薪酬之和)×0.35+(該分支機構資產(chǎn)總額/各分支機構資產(chǎn)總額之和)×0.30。總公司匯總分配給分公司，然后分公司再自己申報分配的報表。